新公司法下修改公司章程的注意事项非常关键，因为公司章程是公司的基本法律文件，规定了公司的组织结构、运营方式、股东权利与义务等核心内容。以下是总结的18个重要注意事项。

1. 遵循法定程序：修改公司章程必须遵循《公司法》规定的程序，包括提议修改、通知股东、股东会决议、主管机关审批（如需要）、公告及变更登记等步骤。

2. 股东大会决议：修改公司章程通常需要股东大会的通过。有限责任公司修改公司章程，须经代表三分之二以上表决权的股东通过；股份有限公司修改章程，须经出席股东大会的股东所持表决权的三分之二以上通过。

3. 内容合法性：修改内容应确保不违反国家法律、行政法规的规定，尤其是关于公司组织形式、经营范围、股东权利与义务、公司治理结构等方面的规定。

4. 公告与备案：修改后的公司章程或其修正案需在工商行政管理部门进行备案，并可能需要在特定媒体上进行公告，以确保透明度和对公众的告知义务。

5. 特殊类型公司要求：对于特殊类型的公司，如上市公司、外资企业等，还需遵守《证券法》、《外商投资法》等相关法律法规的特别要求。

6. 法定代表人变更：新《公司法》规定，公司变更法定代表人的，变更登记申请书由变更后的法定代表人签署，以打破原法定代表人不配合变更登记的僵局。

7. 股东认缴出资期限：新《公司法》规定股东认缴出资期限最长不超过五年，对已设立的公司，出资期限将逐步调整至五年以内。

8. 股东出资责任：新《公司法》将股东出资不足对股东承担违约责任修订为对公司承担赔偿责任，增加了董事会（董事）对股东出资的催缴义务及赔偿责任。

9. 失权制度：明确规定公司可以对未足额出资的股东除权，包括表决权，解决了过去对于未足额出资股东权利限制范围的争议。

10. 股东查阅权：新《公司法》明确了股东可以要求查阅会计账簿、会计凭证，扩大了股东知情权范围。

11. 股东优先购买权：明确了股东转让股权时书面通知其他股东优先购买股权的相关事项，以及“同等条件”的因素，主要包括数量、价格、支付方式和期限。

12. 控股股东损害赔偿：新增控股股东损害其他股东利益，其他股东有权要求公司回购股权的规定，增加了中小股东权益受损时的救济渠道。

13. 修订内容的适应性：在新《公司法》修改后，公司章程的应修订事项是公司在新的时代背景和经济形势下应当关注的重点，股东和公司经营者应对此予以高度重视，明确各自权利义务。

14. 专业法律咨询：鉴于修改公司章程的复杂性和专业性，建议在决定修改章程前，咨询专业法律顾问，以确保修改程序合法、内容合规，并维护公司及所有利益相关者的合法权益。

15. 内部治理结构调整：新《公司法》引入了单层制公司治理架构，公司可以通过章程规定更加灵活地选择适合自身实际情况的公司治理架构，并明确经理的职责、权限范围以及对经理职权的监督和制约相关条款。

16. 股东会与董事会职权简化：新《公司法》对股东会、董事会法定职权进行简化，为公司自治预留了更大的空间，公司可结合实际情况对职权进行更灵活的约定。

17. 审计委员会与监事会职权区分：若公司选择审计委员会与监事会并存，应在公司章程中明确规定二者各自的职权，以避免职能不清的情形。

18. 董事会人数设置：新《公司法》取消了董事会人数上限，公司可以根据公司治理情况在章程设置董事会人数，有利于中小股东更多地参与公司治理。

这些注意事项涵盖了从提议修改到最终备案的整个流程，并强调了合法性、合规性以及对新法规的适应性。在实际操作中，公司需要根据自身的具体情况和需求，结合专业法律意见，审慎地进行公司章程的修改。